在农村自建房的双跑楼梯间中，最佳的布局应当是将楼梯间设置在房屋的中心位置，这样可以使得房屋的空间利用率最高。同时，尽量保留楼梯间周围的空间，方便布置家具和物品，同时也方便走动和通风。最好选择木质的楼梯，既美观又环保。此外，在设计楼梯间的时候，还要考虑到安全因素，如设置扶手、防滑垫等，确保使用时安全可靠。