沈阳般若寺与慈恩寺的区别如下：

地理位置不同 。般若寺位于沈阳市沈河区大南街若寺巷8号；慈恩寺位于沈阳市沈河区大南街慈恩寺巷12号。

历史不同 。般若寺建于1923年；慈恩寺建于1387年（明洪武二十年）。

建筑风格不同 。般若寺为近现代重要史迹及代表性建筑；慈恩寺为辽、金时期建筑风格，是沈阳市现存最大的佛教寺院。

此外，还有文化价值不同等。