长期吃荞麦面会导致出现消化不良、营养不均衡等危害。长期进食荞麦面患者可能会有消化不良、腹泻等临床症状，若患者脾胃虚寒或消化功能较差，长期食用还可能加重病情。

另外，荞麦面中还含有草酸的成分，长期食用会在体内形成草酸钙，容易导致钙的流失，严重甚至会造成骨质疏松。