先天性六指手术农村医保可以报销，但具体报销比例和限额因地区和医院等级而异。

一般来说，农村合作医疗可以报销先天性六指手术的部分费用，但报销比例不是很高。具体报销金额和比例需要咨询当地的医保政策或相关医院。

此外，需要注意的是，不同地区的医保政策可能存在差异，因此具体的报销标准和限额需要以当地政策为准。同时，在进行手术前，建议咨询医生或医院财务部门，了解相关政策和流程，以便更好地享受医保福利。