宝莲寺最初的修建者和出资者是南都赵氏家族。南都赵氏是一个富裕的商业家族，他们在唐代和五代南唐时期都是南都（即今天的南京）的重要商业精英，因此他们有足够的财力来支持这个宏伟的寺庙的建设。

据记载，南都赵氏家族于北宋太平兴国元年（公元976年）出资兴建宝莲寺，当时寺庙的名字叫做“太平慈宁”寺。在随后至今的历史上，宝莲寺经过多次修缮和扩建，成为了中国佛教街坊最大的寺庙之一。

随着时间的推移，宝莲寺的建筑被多次毁坏和重建。最近一次大规模修缮和扩建是在1998年至2008年间，当时宝莲寺进行了大规模的维修和改善，甚至增加了一些新的建筑和景点。目前，宝莲寺已成为南京市的标志性建筑之一，吸引了大量游客和朝圣者前来参观和祈福。