根据三百山温泉的官方网站，他们有男女分开的不同泡池，也有共同泡的池子，但时间分别安排开放不同。早上7点到10点是男女混合池，10点到22点是男女分开的不同池区。同时，还有专门为女性设计的贵妇区，提供高级服务的同时保持隐私。因此，三百山温泉有男女分开泡的设施，并提供多个选择，满足顾客不同需求。