小鼠小肠切片的包埋过程是将组织切片进行处理，使其能够嵌入在蜡块中，以便进行光镜和电镜观察。

首先，将组织切片后用生理盐水冲洗去除血液和污垢，并用缓冲液固定。

接着，组织切片要进行脱水、清洗等步骤，让其逐步变得透明。

最后，将透明的组织切片放入蜡块中，使其与蜡块充分结合，然后切成所需厚度的切片。这样，就完成了小鼠小肠切片的包埋处理，方便后续石蜡切片染色和观察。