并不是所有民事案件被告反诉都适用普通程序，具体情况要根据法律规定和案情来确定。例如，如果反诉的主张是与原案有直接关系的，且权利义务关系清晰、互相独立，则可以适用简易程序。

但如果反诉与原案没有直接关系，或者需要复杂的事实认定和证据审查，就需要适用普通程序。因此，被告反诉应当根据具体情况选择适用的诉讼程序。