区别在于平台不一样。

12306是铁路集团有限公司的专用火车票网上售票系统，也是我国唯一的火车票售票系统。

携程网是通过爬虫抓取12306网页信息，然后放在自家平台上，车次信息同样来自12306。

所以，二者区别只是在于两个平台不同罢了，即使你在携程下单，最终也是携程帮你在12306下单。