宠物在经过长途运输后，可能会出现一些健康问题，其中最常见的就是腹泻。这可能是由于多种原因引起的，例如水土不服、应激反应、饮食不当或感染病原体等。

首先，宠物在长途运输过程中可能会因为环境变化、饮食不适应等原因出现水土不服的情况，导致肠胃功能紊乱，引发腹泻。此外，宠物在运输过程中可能会因为紧张、焦虑等原因产生应激反应，也可能引起腹泻。

其次，宠物在运输过程中可能会吃到不干净的食物或水，从而引发肠胃炎等消化系统疾病，导致腹泻。此外，如果宠物在运输过程中感染了病毒或细菌，例如犬细小病毒、沙门氏菌等，也可能出现腹泻等症状。

因此，为了减少宠物在长途运输后出现腹泻等健康问题的风险，建议提前做好准备工作，如选择合适的运输方式和专业的运输公司、提前做好宠物的饮食和卫生管理、准备必要的药品和应急措施等。同时，在运输后应该留意宠物的身体状况，及时发现问题并寻求兽医的帮助。