祁门和黟县是在历史上形成的地方行政区划的分割。最初，在唐代，祁门和黟县并不是独立的行政区域，而是归属于信州。随着历史的发展，当地政治、经济和文化的差异逐渐加大，最终在明代中期，祁门和黟县分别成为两个独立的县级行政单位，有了独立的政治和经济管理机构。现在，祁门和黟县仍然是独立的县级行政单位，归属于安徽省黄山市。