三方审核通过后，一般来说是不允许再进行修改的。三方审核是指由第一方（组织内部）、第二方（组织相关方）和第三方（与组织无直接关系的其他组织）进行的审核。在审核过程中，各方会对组织的管理体系、过程和产品等进行全面评估，以确保其符合相关标准和要求。

一旦三方审核通过，意味着组织已经达到了一定的标准，获得了认证或批准。在这种情况下，组织应当严格遵守审核时所涉及的标准和规定，以确保持续符合要求。

然而，在某些特殊情况下，可能存在审核通过后仍允许修改的可能性。比如，在某些认证体系中，如 ISO 9001 质量管理体系认证，组织在认证周期内（通常为三年）可以进行一次中期审核。这次审核旨在确认组织在认证周期内持续符合标准要求，并对其管理体系进行更新和改进。

总的来说，三方审核通过后，组织应尽力确保遵循相关标准和规定，避免重大改动。在特定情况下，如中期审核等，可以进行一定程度的修改和完善。但具体是否允许修改，还需根据审核标准和组织所处的认证周期来判断。在此过程中，建议与审核机构保持良好沟通，以确保合规。