支付宝小程序登记注册身份验证的时间取决于多个因素，包括网络速度、系统繁忙程度以及用户提交的信息是否准确等。通常，如果网络连接稳定，提交的信息准确无误，身份验证的过程可能需要几分钟到十几分钟不等。

在这个过程中，用户需要按照页面提示录入自然人身份信息，同意协议并进行人脸识别，完成首次身份认证。完成首次身份验证后，可查询当前自然人所有待办事项。在待办列表中选择要进行业务确认的记录，按照系统提示确认事项无误后，即进行二次身份验证。完成身份验证后，小程序展示正在进行业务确认的事项信息和采集的人脸照片，由用户进行最终确认并签字。

如果在身份验证过程中遇到任何问题，建议联系支付宝客服或小程序的技术支持团队寻求帮助。