二者的主要区别如下：

第一、 制作方式不同：其中酸奶粉是将乳酸链球菌及乳酸杆菌混合接种于鲜牛奶，再经过一系列发酵而打造成的；而发酵酸奶乃是以牛奶为原料之后通过巴氏消毒然后再在牛奶中加入发酵剂而打造成的。

第二、 形态不同：其中酸奶粉是粉末状，而发酵酸奶是半凝固状态。

第三、 特点不同：其中酸奶粉能维持发酵剂的活力和风味，能直接用于酸奶的制作和发酵，而发酵酸奶除了保留鲜牛奶的营养之外还产生了大量的维生素b族。