慢性疾病报销医药费流程如下：

1、由患者本人向社保中心提出申请，填写正式的申请表；

2、将二级以上医院的诊断证明材料上报社保中心，经专家委员会鉴定审核后，办理慢性病证历；

3、患者在指定的医院门诊部看病购药；

4、在规定的时间内，到社保中心予以报销慢性病医疗费用。