培藻剂的正确使用方法需要根据水质的不同进行调整。在清瘦水池塘中，如放苗前一般是刚清完塘或消毒完的池塘，水体中藻类和肥料都不足，可以引进一部分优质的老塘水，让水中的藻种多一些，然后再施生物肥料，这样可以使藻类慢慢长起来。

对于浑浊水池塘，例如水中泥沙颗粒过多，藻类太少的情况，建议先换一部分新鲜水，然后用净水底改把水中的泥沙沉降下去，让水体变清澈一些，再用生物肥料来培养藻类。

若池塘中浮游动物较多，需要注意的是避免使用大量化肥进行培藻，因为大部分营养会被池泥吸收，可能会引起底质恶化，也容易造成蓝藻等有害藻类过度繁殖。因此，建议选择定向培育绿藻和硅藻的定向肥来培水育藻。

此外，具备优良的水源也是培藻的重要技术要点之一，避免过量使用消毒剂或杀藻剂，以免破坏水源中的藻种。

一般来说，每三天左右施用一次肥，如氨基酸肥水膏、酵素肥、多肽硅藻肥等，并五六天左右施用一次菌种，如芽孢、酵素、乳杆菌等。少量多次施肥的效果优于一次性大量施肥。

最后，阳光充足的天气是进行培水的良机，因为阳光下藻类生长较快，建议在晴天的上午使用培藻的营养素。