要清除立林门禁主机中的卡数据，可以按照以下步骤进行操作：

首先，在门禁主机面板上输入管理员密码，进入菜单界面，选择“卡片管理”菜单，再选择“清除卡片”选项，然后按下确认键。

在提示确认清除卡片数据后，再次按下确认键即可完成清除卡数据的操作。注意，在清除卡数据前需要确认卡片信息是否备份，并在清除后重新添加卡片信息。