如果公司的收取的进项发票，被认定为虚开发票，就要接受处罚。如果故意与对方合谋虚开的，那么以虚开发票定罪，并追补抵扣的增值税和所得税，加收滞纳金，并罚款一倍至五倍。

如果对方虚开，但确系购买了货物，是受骗，则需补交抵扣的税款。