合作医疗费用的具体标准和缴费方式可能因地区和政策而异。一般来说，可以按以下步骤来缴纳合作医疗费用：1.了解当地的合作医疗政策和缴费标准，通常可以在当地卫生计生委、社保局、医保中心等部门了解相关信息。

2.到当地社保、医疗保险中心或指定的银行、邮局等场所缴纳费用，一般可以使用现金、银行卡等方式缴纳。

3.在缴费的过程中，应注意确认费用的具体项目和金额，并妥善保管相关单据和缴费证明。

如果发现合作医疗费用存在未知的额外费用，例如题目中提到的额外的200元，建议咨询当地卫生计生委、社保局、医保中心等部门，并提供具体情况进行咨询，以确定缴纳方式以及解决方案。