猫咪细菌性结膜炎和病毒性结膜炎在病因和症状上有所不同。细菌性结膜炎是由细菌感染引起的，常见症状包括结膜充血、眼部分泌物增多、眼睛发痒等。而病毒性结膜炎则是由病毒感染引起的，除了上述症状外，还可能伴有流泪、眼睛发炎等，常见的病毒有猫传染性腹膜炎病毒和猫病毒性鼻气管炎病毒。在治疗时，应根据病因选择合适的药物。