1、拿不到经济补偿：如果员工在不想继续工作了，或者因为公司的一些原因，例如不缴纳社保、不签劳动合同等，这种情况既不提出离职，也不提交被迫解除劳动通知函的情况下，直接不来了，连续三天之后，公司是可以以员工旷工为由解除劳动关系，并且还不用支付经济补偿的。
2、可能承担赔偿责任：因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。
3、公司可以暂停支付经济补偿金：用人单位的经济补偿金可以在办结工作交接时支付，换言之，就是如果劳动者未办理工作交接等离职手续的，那么用人单位是可以暂停发放经济补偿金，待员工办理完离职后续后再予以支付。