根据中国的相关法律法规，乙肝患者在申办营业执照时并不会因为患有乙肝而直接被拒绝。营业执照的办理主要是根据相关法律规定的经营资格、申请条件和程序来审核，而患有乙肝并不会影响到这些条件。然而，应该注意的是，在食品、饮料等特定行业从事经营时，可能会受到相关健康检查和证明的要求。

因此乙肝患者在办理营业执照时，需要了解相关法律法规和政策，积极配合相关的健康检查和要求，以确保自身的合法经营权益。