根据我国《侵权责任法》和《保险法》的相关规定，被代位赔偿后，赔偿权利人（即保险公司）与赔偿义务人（即第三方责任人）之间可以协商减免赔偿。

首先，根据《侵权责任法》第15条规定：“承担侵权责任的方式有：（一）赔偿损失；（二）赔礼道歉；（三）消除影响、恢复名誉；（四）其他应当承担侵权责任的方式。”其中，赔偿损失是侵权责任的主要方式。在代位赔偿的情况下，保险公司作为赔偿权利人，可以与赔偿义务人协商赔偿金额、支付方式等事项。

其次，根据《保险法》第68条规定：“保险人向被保险人或者受益人支付保险金后，保险合同对被保险人或者受益人的赔偿责任消灭。但是，保险人依法代位行使被保险人对第三者的赔偿请求权的，不影响被保险人或者受益人对第三者的赔偿请求权。”这意味着，保险公司作为保险人依法代位行使被保险人对第三者的赔偿请求权后，被保险人或受益人对第三者的赔偿请求权并未消灭。因此，在代位赔偿后，保险公司与赔偿义务人之间仍有协商的空间。

然而，需要注意的是，在协商减免赔偿时，应当遵循公平、合理、自愿的原则，并在不损害国家利益、社会公共利益和他人合法权益的前提下进行。此外，如果保险公司与赔偿义务人达成减免赔偿协议，应当及时通知被保险人或受益人，并依法办理相关手续。

综上所述，被代位赔偿后，赔偿权利人（即保险公司）与赔偿义务人（即第三方责任人）之间可以协商减免赔偿。但在协商过程中，各方应遵循相关法律法规，确保公平、合理、自愿，并不损害他人合法权益。