会，孔雀鱼可以杂交。如果不讲究孔雀鱼品种的纯度与否，多种孔雀鱼就可以进行混养。不过，混养的孔雀鱼脾气及性格应相吻合，这样才能不易触发孔雀鱼之间的“战争”。

孔雀鱼自身不会因为种类的不同而选择不繁殖。在孔雀鱼的眼中只分雌鱼与雄鱼。只要是性成熟的异性，都有可能繁殖。