区别主要在于名称不同、区域不同和行政区划不同。马踏湖位于桓台县，而麻大湖位于博兴县。尽管它们都是同一水域湿地，但分属于不同的行政区划。麻大湖是国家湿地公园、国家4A级旅游景区，拥有丰富的自然风光和非物质文化遗产。